মোগল শাসনের সময়কে পাঠকের সামনে স্পষ্ট করার উদ্দেশ্যে 'মোগলনামা'র প্রথম খণ্ডে বাবুর থেকে আওরঙ্গজেবের মৃত্যু পর্যন্ত মোগল শাসনামলের ঘটনাবলী বিশ্লেষণ করার মাধ্যমে মোগল ভারতের একটি চিত্র তুলে ধরার প্রয়াস করা হয়েছে। সাধারণভাবে মোগল আমল বলতে এই ছয় সম্রাটের শাসনকালই পরিচিত।
আওরঙ্গজেব পরবর্তী, অর্থাৎ ১৭০৭ খ্রিষ্টাব্দের পরের মোগল ইতিহাস কেবল মোগলদের ইতিহাস থাকেনি। এ সময়ের সঙ্গে মারাঠা, শিখ, বাংলা ও অযোধ্যার নওয়াবী, দাক্ষিণাত্যের নিযাম, ব্রিটিশদের ক্ষমতা দখলের চেষ্টা এবং সর্বোপরি সিপাহী বিদ্রোহ জড়িত। তাই এই খণ্ডে উঠে এসেছে নাদির শাহ্‌র দিল্লী অভিযান, আবদালীর আক্রমণ এবং পানিপাতের তৃতীয় যুদ্ধ, এমনকি পলাশীর যুদ্ধ।
‘মোগলনামা'র দ্বিতীয় খণ্ডে, মোগল শাসনামলের দ্বিতীয়ার্ধ সম্পর্কে বিস্তৃত আলোচনার চেষ্টা করা হয়েছে। সময়ের হারিয়ে যাওয়া ইতিহাসের বিশ্লেষণ এই বই।