জুনাইদ আমিন চৌধুরী ২০০০ সনে ক্যান্টনমেন্ট পাবলিক স্কুল ও কলেজ থেকে মাধ্যমিক এবং চট্টগ্রাম কলেজ থেকে ২০০২ সনে উচ্চ মাধ্যমিক সম্পন্ন করেন। অতঃপর ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের মৃত্তিকা, পানি ও পরিবেশ বিজ্ঞান বিভাগ হতে স্নাতক ও স্নাতকোত্তর ডিগ্রি এবং পরবর্তীতে ব্র্যাক বিশ্ববিদ্যালয় থেকে উন্নয়ন অধ্যয়ন বিভাগে দ্বিতীয় স্নাতকোত্তর ডিগ্রি অর্জন করেন। তিনি বর্তমানে একটি স্বনামধন্য বহুজাতিক কোম্পানিতে কর্মরত রয়েছেন। স্কুল, কলেজ ও বিশ্ববিদ্যালয় জীবনে সহপাঠ্যক্রমিক কার্যাবলিতে বরাবরই তাঁর সক্রিয় অংশগ্রহণ ছিলো। তিনি ছাত্রজীবনে ক্যান্টনমেন্ট পাবলিক স্কুল বিতর্ক দল, চট্টগ্রাম কলেজ ডিবেটিং ক্লাব, ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের ডিবেটিং সোসাইটি এবং ফজলুল হক হল ডিবেটিং ক্লাবের বিতার্কিক ও সংগঠক হিসেবে দলকে নেতৃত্ব দিয়েছেন। তিনি বিতার্কিক হিসেবে বিভিন্ন আন্তঃ স্কুল, আন্তঃ কলেজ, আন্তঃ বিশ্ববিদ্যালয়সহ বাংলাদেশ টেলিভিশন বিতর্ক প্রতিযোগিতায় অংশগ্রহণ করেন