শওকত জাওহারের জন্ম ১৯৮৩ সালে নোয়াখালী জেলার দ্বীপ হাতিয়ায়। পিতা মুহাম্মদ আবদুশ শহীদ এবং মাতা আজমলেন্নেছা। তিনি জাতীয় বিশ্ববিদ্যালয়ের অধীনে রাষ্ট্রবিজ্ঞানে বিএসএস (অনার্স) ও এমএসএস সম্পন্ন করেন। পিতার প্রেরণায় এবং পারিবারিক লাইব্রেরির ধর্মীয় বই পড়ে তিনি ধর্মানুরাগী হয়ে ওঠেন। মুসলিম সমাজ ও সাহিত্যে ধর্মীয় চিন্তার বিভিন্নতা তাঁকে তুলনামূলক ধর্মীয় অধ্যয়নে উদ্বুদ্ধ করে।
২০০৮-২০১০ সালে তিনি কুরআন রিসার্চ ফাউন্ডেশনে (QRF) রিসার্চ ফেলো হিসেবে দায়িত্ব পালন করেন এবং বেসিক কুরআনিক এরাবিক গ্রামার কোর্সে প্রশিক্ষণ গ্রহণ করেন। ২০১১-২০১৩ সালে কুরআন গবেষক তৈয়াবুর রহমান গোপালগঞ্জীর সান্নিধ্যে কুরআনের ব্যাখ্যা বিষয়ে মৌলিক জ্ঞানার্জন করেন এবং ওয়ার্ল্ড আল কুরআন রিসার্চ সেন্টারে রিসার্চ ফেলো ছিলেন।
বর্তমানে তিনি একটি বেসরকারি উচ্চ বিদ্যালয়ে শিক্ষকতা করছেন এবং দি ইনস্টিটিউট ফর কুরআনিক রিসার্চ এন্ড অ্যাপ্লিকেশনে (দি ইক্বরা) রিসার্চ ফেলো হিসেবে কাজ করছেন।